华中农业大学水产学科是1970年在全国高等农业院校中最早设立的水产类学科点。1972年开始招收淡水渔业专业本、专科生；1984年获水生生物学（理学）硕士学位授予权，开始招收硕士研究生。1988年增设名特水产养殖本科和渔政管理专科专业。1993年筹建并获得水产养殖硕士学位授权点，当年开始招收水产养殖专业硕士研究生。1997年国家进行本科、硕士、博士专业调整，将淡水渔业和名特水产养殖本科专业合并为水产养殖学本科专业。1994年水产养殖学科被批准为湖北省重点学科。1996年水产养殖学专业获博士学位授予权并于当年开始招生；1998年获水产一级学科博士授予权，水产学所涵盖的水产养殖、捕捞学、渔业资源学三个二级学科全部获博士和硕士学位授予权，同年获水生生物学专业博士学位授予权。1998年水产养殖学科通过国家“211工程”重点学科建设部门预审，2002年被教育部批准为国家重点学科，2006年通过评估，全国列第3位。2003年获批本科专业水族科学与技术，于2004年开始招生。同年获准在水产一级学科下自主设置湿地资源与环境二级学科，并于2004年开始招收硕士、博士研究生，2013年停招。2012年获准在水产一级学科下自主设置水产动物医学二级学科，并于2013年开始招收硕士、博士研究生。2007年水产一级学科博士后科研流动站获得批准。2008年、2012年水产一级学科被评为湖北省一级重点学科，水产养殖二级学科被评为湖北省优势学科。水产一级学科通过2004年、2008年、2012年全国评估，均列第3位。